随后，会津、桑名两藩大队人马赶到，如临大敌地封锁了池田屋附近的三条地区和长州藩邸。从这一夜起，新选组“壬生刽子手”、“壬生狼”的大名迅速自京都、大坂传遍了整个日本。
看看浪士们的计划吧：一、劫持天皇往长州。二、暗杀中川宫亲王和京都守护职松平容保。三、在京都四面放火。京都居民自保元平治、应仁的战火后，非常惧怕火灾。如果没有新选组的强袭池田屋，京都会怎样呢？
翌月的禁门之变给了答案。在七月十九日的战斗后，京都由于长州兵的进犯而化为火海。大火三天后才被扑灭。
上京的八百二十九町中一百七十六町被烧毁，二万四千五百七十四间房中五千四百三十五间化为灰烬。下京的灾情更为惨重：二万四千八百四十间房中有二万三千九十二间被毁，维新后花了很长时间才得以修复。三都之首的京都昔日繁华的街道上尸体狼藉。
新选组因此事而声名大噪，而尊王攘夷派则损失惨重，重要人物吉田稔磨、北添佶摩、宫部鼎藏、大高又次郎、石川润次郎、杉山松、松田重助死亡（他们通常被称为“殉难七士”）。桂小五郎（后来的木户孝允）幸免于难。
长州藩在此事后举兵上京，引起禁门之变。池田屋事件可能令明治维新延迟了一年，也有人认为此事反而刺激尊王攘夷派加快推动维新。
池田屋事件是日本近代史上的重要事件，它“使明治维新推迟了一年。”这次打击使长州的尊攘派暴跳如雷，真木和泉、久坂玄瑞、来岛又兵卫等激进派立刻压倒了高杉晋作等开国派，决定兵进京都。高杉等人在冷静地分析之后，把日本的维新导向了开国、倒幕的正确道路。
福田定一（司马辽太郎）的看法是，由于池田屋事件的冲击，使萨长帮联合各藩兵进京都，从而提前了明治维新。
