炙手可热
同治二年农历五月十日（1863年6月25日），石达开在成都经骆秉章批准，被清军凌迟。清廷再加赐骆秉章太子太保。同治三年（1864年），天京（南京）陷落之时，清廷论功行赏，骆秉章加恩赏一等轻车都尉世职，并赏戴双眼花翎。同治六年（1867年），骆秉章再升任四川总督、协办大学士。其地位声势赫赫，炙手可热。
骆秉章远离京师的时候，朝廷有关国家大政方针的决策朝廷仍然都要问计于他。与此同时，云南、贵州、陕西、甘肃等省的重要人事任命和政务安排，均会事先征求骆秉章的看法，当时政界有评：“二公东西相望，天下倚之为重”，其政治地位同曾国藩旗鼓相当，可见两位政坛巨擘对当时的大清王朝是何等的重要。多年辛劳征战使骆秉章眼疾加剧，骆秉章多次请辞回家，皇帝却以骆秉章“老成硕望、调度有方”为由不予获准，仍让他“力疾视事”，仅赏以短假调理要求其继续任职。
病逝任上
同治六年（1867年）农历十一月十七日（公历12月12日），骆秉章因病逝于任上。终年74岁。清政府赠太子太傅，入祀良祠，给谥号文忠。骆秉章逝世消息一传到民间，民众自发罢市缟素，丧车所过，哀音相随，连绵不断。因悼念场面太过盛大，官府怕生出事端，因此加以限制，结果惹怒了百姓，差点闹出一场风波，因此《清史稿》也评价说：“川民感其削平寇乱，出于水火，乃其殁，巷苦罢市，遗爱之深，世与汉诸葛亮，唐韦皋并称”。百姓把骆秉章比作诸葛亮和韦皋，足见骆秉章治川功德深入人心。骆秉章逝世后，湖南和四川民间均自发建起宗祠，供世人瞻仰和纪念。
