薨逝
清崇德六年（1641年）九月，皇太极率领八旗劲旅和漠南蒙古科尔沁等部铁骑，与明朝军队洪承畴部进行松山锦州决战。正当双方数十万大军刀光剑影生死搏杀如火如荼之际，十二日盛京使节惶惶来报“关雎宫宸妃有疾”。既爱江山也爱美人的皇太极，闻知海兰珠生病，立即召集诸将令他们留下固守，自己于次日凌晨即启驾返还盛京。一路行色匆匆，至十七日夜驻跸旧边，刚过一更时，盛京使节又报“宸妃病笃”。得知海兰珠病势沉重，皇太极连夜拔营，催动战马，恨不得插上双翼飞回自己的爱妃身边。
十八日凌晨，告之海兰珠已气绝身亡的第三次奏报“宸妃已薨”，对于途中的皇太极真如五雷轰顶，他飞马入盛京，冲进大清门，直扑关雎宫，但的确是晚了一步，关雎宫里香消玉陨，时年三十三岁的海兰珠，已经永远闭上了眼睛。这里，只剩下皇太极抚尸哀痛的身影和悲悼恸涕的哭声。
美人气已绝，英雄心欲碎。皇太极怎么也难以接受海兰珠病逝这个残酷的现实。他曾几次因悲痛过度而昏迷过去，这令皇后宫妃和诸王大臣惶惶不安，纷纷劝告他“自保圣躬，勿为情牵，珍重自爱”。皇太极也自责说：“太祖崩时，未尝有此，天之生朕，岂为一妇人哉”。但海兰珠的音容笑貌仍令他时时难以忘怀。红颜知己永别而去，皇太极即使贵为天子，也别无他法，所能做的，只有寄托哀思。他为自己的爱妃举办了隆重的葬礼，并频繁地举行各种祭奠。九月廿九初祭之日，他亲率文武百官及其夫人们前往。奠酒行礼后，宣读的祭文饱含深情，“皇帝谕：
“皇帝致祭于关雎宫宸妃。尔生于乙酉年。享寿三十有三。薨于辛巳年九月十八日。朕自遇尔。厚加眷爱。正欲同享富贵。不意天夺之速。中道仳离。朕念生前眷爱。虽没不忘。追思感叹。是以备陈祭物。以表衷悃。仍命喇嘛僧道讽诵经文，愿尔早生福地。”最后，皇太极在海兰珠的墓前亲自奠酒三爵，诸王大臣和外藩属国使节祭奠礼。
在此后的岁月里，月祭、大祭、冬至祭、去世周年祭……，次次仪典隆重肃穆的祭礼，都饱含着无限的悲思；篇篇文词典雅庄重的祭文，都表达着无尽的哀意。甚至在当年岁暮大祭列祖列宗之时，皇太极也与皇后率百官及其夫人们前去祭奠海兰珠，让爱妃去世后还尽享哀荣；当次年正月元旦大贺之际，他竟传谕“以敏惠恭和元妃丧，免朝贺，停止筵宴乐舞”，因爱妃之逝而停办了朝中重大典礼。群臣们见皇帝平日在宫中时常睹物思人，每当想起海兰珠即伤心落泪，就多次陪他出京射猎消遣。但海兰珠就安葬在盛京地载门外五里之处，皇太极几乎每次射猎时，都要有意无意地经过她的墓地。眼见心中的爱妃已撒手人寰、尸埋坟冢、不能复生，皇太极每次都要悲痛欲绝、泪如雨下地哭祭一番。
清崇德七年（1642年）二月，松山锦州大战告捷，清军取得了决定性胜利，明朝率军将领洪承畴、祖大寿被俘后降清。当年四月，皇太极在盛京皇宫的大政殿为此二人赐宴庆贺，但在这盛宴之上却没有他这位东道主的身影。对洪、祖二人的解释是“朕未服视朝衣冠，又不躬亲赐宴，非有所慢于尔等也。盖因关雎宫敏惠恭和元妃之丧未过期，故尔”。原来，他为了表示对海兰珠忠贞不渝的爱情和无限的哀悼，没有参加这欢庆的喜宴。皇帝都停止了宴乐，但却还有不识相的王公贵族不遵制默哀，硬往枪口上撞。据史料记载，在海兰珠的丧期内有不从禁令私自作乐的，后经查出，遭受处罚者达数十人之多。其中郡王阿达礼和辅国公扎哈纳的王公桂冠都险些因此而被削掉；其余人均遭到没收家产、罚银、鞭笞、贯耳鼻等处罚。
