再领军趋近通州，明总兵满桂、侯世禄屯兵顺义，阿巴泰偕同岳托击败他们，俘获了千余匹战马、一百匹骆驼，顺义城也被攻下。当时袁崇焕、祖大寿的二万士兵屯守在北京广渠门外，阿巴泰偕同莽古尔泰率领军队攻打他们。后听闻明军在右方向有伏兵，诸贝勒率军入隘后必定趋向右方，如果在中路突破的话，就和逃避敌人同罪。
豪格军趋向右方，并且打败了明朝的伏兵，转战至北京城下。阿巴泰却从中路出军，虽也破明军，应当和豪格的大军回合后再停止攻击，诸贝勒商议违约之罪，阿巴泰应当被削去爵位。
皇太极却指阿巴泰并非怯懦，只是要照顾他的二子，才与豪格失约，决定对阿巴泰宽容处理不加罪于他。阿巴泰率大军至通州，焚烧明朝的舟楫，并攻打张家湾。而后跟从皇太极到达蓟州，从山海关方向来的五千明军杀来，阿巴泰奋起攻打，围歼明军。
天聪四年（1630年），阿巴泰跟从皇太极围攻永平，与济尔哈朗一起斩叛将刘兴祚。皇太极再命阿巴泰守永平。明军攻打滦州，阿巴泰偕同萨哈廉开赴救援，明军被打退后他们也跟着撒退了。
天聪五年（1631年），皇太极仿照明朝制度设立六部，阿巴泰奉命执掌工部。他的工作多有疏漏，使皇太极大失所望。皇太极批评说：自设六部以来，礼、刑、工三部办事多有缺失，至于工部更不及他部。这都是贝勒才短，承政（当时各部最高长官称“承政”，即后来的尚书）疏忽，启心郎（辅佐贝勒、尚书的官员，后裁撤）怠惰所致。
对阿巴泰来说，栉风沐雨的军旅生涯，刀枪剑戟的阵前厮杀，是他人生的主旋律，而在衙门中正襟危坐，应对烦琐的公务，却令他英雄气短。工部负责工程建筑，少不了销算各种账目，这令阿巴泰感到头痛。他甚至连工部的衙门都懒得去，至多在府第中敷衍了事。皇太极的批评，说明阿巴泰在工部少有建树，很不称职。
天聪七年（1633年），阿巴泰奉命修筑兰磐城，皇太极赐给他御用蟒衣一袭、紫貂皮八套、马一匹。六月，皇太极向大臣们询问，打明朝、朝鲜、察哈尔这三个地方，先打哪个。阿巴泰请求先讨伐明朝。八月，阿巴泰率军攻打山海关，俘数千人后退兵。皇太极迎接并慰劳他们，但是责备他不肯深入进军。
天聪八年（1634年），跟从皇太极大军出征宣府，到达应州，阿巴泰攻克灵丘和王家庄两地。
倍受冷落
崇德元年（1636年）四月，皇太极称帝改元，定宗室世爵，幼弟多尔衮、多铎及子侄辈的豪格、岳讬都晋封亲王，阿济格也晋封为郡王。阿巴泰年齿徒长，仍封贝勒爵，只是在贝勒爵位前加上了“饶余”（满语为富裕之意）的美号，以示差异。与亲王比，贝勒爵位整低了两级。对此，他心怀芥蒂，对皇太极总有抵触。
六月，同武英郡王阿济格等征明，克雕鹗堡、长安岭堡，薄延庆州，先后克定兴、安肃、容城、安州、雄县、东安、文安、宝坻、顺义、昌平，遇敌五十六战皆捷，生擒总兵巢丕昌等，又遣都统谭泰等设伏，斩遵化三屯营守将。
清军出关，歼灭了在后面追击的明兵获马一百四十余匹。捷闻，勅谕嘉奖，赐马二匹。九月，凯旋，皇太极亲自迎接。十二月，皇太极亲征朝鲜，命阿巴泰驻噶海城，收集边民防敌。
崇德二年（1637年）二月，遣兵入明义州界，捉生获二人。是月，朝鲜降，皇太极班师，阿巴泰携驻噶海兵还沈阳。
崇德三年（1638年），皇太极讨伐喀尔喀，阿巴泰与礼亲王代善留守，阿巴泰修筑辽阳都尔弼城，再次疏通盛京至辽河的道路，道路宽有十丈，高三尺，两边修筑了濬壕。多尔衮率军攻打明朝，以阿巴泰为副将，从长城口进入，越过明都北京趋近涿州，直抵山西。又向东直至山东临清，攻克济南。并且攻打天津、迁安，出兵青山关后退军。回到盛京被赏赐马二匹、银五千两。
崇德四年（1639年），阿巴泰偕同阿济格攻打锦州、宁远。
崇德五年（1640年），阿巴泰偕同多尔衮在义州屯田，分兵攻克锦州城西九台，收割其稻禾；又攻克小凌河西二台。偕同杜度伏兵宁远，截断明军运道，夺米千石。移师打败明军杏山、松山兵马。当时大军连番围锦州，阿巴泰屡次在松锦之间来回行军。
崇德六年（1641年），阿巴泰以跟从多尔衮离着锦州三十里的地方为营，以及遣士卒私自回家的罪过，论罪削爵，夺去所属户口。皇太极下诏宽恕，只罚银二千两。跟从皇太极大破洪承畴十三万援兵，获马五百七十匹，歼敌数万。
崇德七年（1642年），锦州出降，偕同济尔哈朗一起围攻杏山，攻克后还守锦州。论功行赏时，赏赐蟒缎七十匹。同年十月，阿巴泰特授奉命大将军，率军讨伐明朝，内大臣图尔格为副将。大军自黄崖口进入明朝边境，在蓟州打败明总兵白腾蛟、白广恩等人，并连续攻破河间、景州。趋近兖州，擒斩明鲁王朱以派及乐陵、阳信、东原、安邱、滋阳诸王。
分兵攻打莱州、登州、青州、莒州、沂州等地，向南直至海州。回军时攻打河北沧州、天津、三河、密云。一共攻克八十八城，逼降六城，俘虏人口牲畜九十二万，掠得黄金一万二千两、白银二百二十万两。还略沧州、天津、三河、密云。
崇德八年（1643年）五月，全师由墙子岭退军回师，皇太极派遣济尔哈朗、多尔衮等于盛京郊外三十里迎接阿巴泰大军，并赏赐白银万两。
皇太极在位的18年中，阿巴泰因各种过失受到的处罚不少于10次。耐人寻味的是，他虽屡屡被罚，只是罚银、罚物，银子固然赔了不少，却从来没有受过降爵或削爵的重惩。原因在于：其一，阿巴泰一生小错不断，大错不犯；其二，他出身偏房，长期被排斥在最高权力核心以外，这反而成全了阿巴泰，一次次骨肉相残的争斗，从来没有波及到他。
其三，他身经百战，战功卓著，在朝中享有很高声望。其四，对这位爱发牢骚的兄长，皇太极不能不有所宽容。当然，皇太极的宽容是有限度的，比如他对桀骜不驯的大贝勒阿敏、莽古尔泰就不讲宽容，而是毫不留情地把他们置于死地。他对阿巴泰网开一面，是因为后者既出身偏房，又有勇无谋，对他从来构不成威胁。
晚年逝世
顺治元年（1644年）四月，晋封为多罗饶余郡王。
顺治二年（1645年）正月，阿巴泰统率左右两翼出兵镇守山东，剿灭满家洞土寇后再退兵。满家洞为活跃在山东嘉祥一带的抗清武装，他们挖遍地洞，出没其中，形成一定声势。清军用土石塞填地洞，攻破十几处。继而阿巴泰派遣都统准塔击败驻扎在徐州一带的南明军队，积极准备南下。
顺治三年（1646年）三月二十五日，阿巴泰病逝，终年五十八岁。顺治八年（1651年）二月，以其子岳乐袭爵。
康熙元年（1662年），岳乐晋封和硕亲王，阿巴泰被追封为和硕饶余亲王。康熙十年（1671年），追谥号为敏。乾隆十九年（1754年）入盛京贤王祠。
