《东巴经》中还有天花、麻风等象形字，反映了纳西族很早就注意对疾病的研究。还记载有：“三滴血作变化，变成了千千万万跳蚤和臭虫，变成千千万万苍蝇，使人类发生疾病”。三滴血如此变化，未免近于荒诞，但跳蚤、臭虫、苍蝇带来疾病却是正确的。还有“药”字的象形字，是花上流出汁水，可见其字源也在于用中草药汁治病。
《崇搬图》还讲到，可以用针灸和按摩来治病，也是很有价值的记载。《东巴经》中记载有一百八十种药丸，“甜的九种药水，苦的十种药水”，甚至还有不病之药和不死药。不死药和不病之药带有神话色彩，体现了古代纳西人民希望长寿健康的愿望。
这里所记载的药，尽管有些不科学，如金气银气的药水，松石墨玉的药水等，但也有一些，如菖蒲、姜茶、鹿角、岩羊角等等，的确可以用来治病。《崇仁潘迪找药》中有这样描写：药水绿油油，毒水绿油油，药花黄生生，毒花黄生生，分不清药水还是毒水，药花还是毒花。
崇仁潘迪就守在那里，看见一只野猪喝了口毒水，痛得就象要死；喝了口药水，立刻蹦跳上去了。又看了三天，一只白鹿啃了一朵毒花，痛得好像要死；啃了一朵药花，立刻又蹦跳上去了。于是分清了药水和毒水，药花和毒花。
这不是无中生有编出来的，而是古代纳西人千方百计识别药水毒水，药花毒花的生动写照。《东巴经》还多次讲到“做牛药马药”，这是早就有兽医的一个证明。也还记载有白谷的白穗病，红麦的黑穗病，大麻种的虚壳病，蔓菁种的腐烂病，也说明对农作物病虫害早有研究。
《东巴经》还在一定程度上反映了古代纳西社会的家庭形态。从忍利恩有兄弟五人，姊妹六人，兄弟姊妹互相匹配，互为夫妻。这种兄弟姊妹互为夫妻的血缘家庭，是人类发展史上最原始的家庭形态。
《东巴经》详细记载了丁巴什罗的世系，在他诞生之前，先有七代祖母，后有九代祖父，反映了先有母系家庭，然后才有父系家庭。丁巴什罗为了制服女魔司命麻左固松麻，对她说：我在天上有了九十九个妻子，一百个还不满一个，特意再来找一个。这个女魔欣然答应。它反映了母系社会的遗迹。
在《东巴经》中，有不少地方讲到天地、日月、星辰、山水、人类的起源，只及鼠、牛、虎、兔、龙、蛇、马、羊、猴、鸡、狗、猪等等的来历，这是古代纳西初民对万物起源的探索。值得注意的是，万物都是由蛋变化而来。
乍一看，未免有点可笑，但是认真加以研究，却是原始唯物主义和朴素辩证法的自然观的一个反映。一部宗教经书，叙述万物起源，不是宣扬神造万物，而是讲述蛋变万物，甚至连天神都是由蛋变化而来，这是《东巴经》与其他宗教经典不相同的地方。
《东巴经》中还讲到，世界万物的本原是佳音和佳气。许多《东巴经》的开头，都这样写道：很古的时候，天地还没有奠定，日月星辰还没有出现，山川木石还没有形成，上方发出了佳音，下方发出了佳气，佳音佳气起变化……白色的天地出现了，自色的日月星辰出现了，白色的山川、岩壁和海子出现了。
这种讲物质，讲变化的音气说体现了古代朴素的自然观，虽有其历史局限性，但在本质上却有其正确的地方。
《东巴经》的研究价值当然远不止于此，这部宗教经典在历史上有着重要地位。马克思主义者是无神论者，是反对宗教的，但并不简单地否定宗教，因为“宗教世界只是现实世界的反射。”我们只要坚持辩证唯物主义和历史唯物主义，也就可以透过宗教世界去探索当时的现实世界。
当然，《东巴经》毕竟是宗教经典，是宣扬宗教迷信的，对人们也确实有毒害和麻醉的作用。对此绝不能忽视。
我们对待《东巴经》，应该和对待其他民族文化遗产一样，要从实际出发，不能不加区别地肯定一切，要在肯定其精华的同时，看到其消极的、有害的糟粕。从而做到剔除糟粕，吸收精华。我们把《东巴经》当作纳西族文化遗产进行抢救、整理、研究的时候，必须充分注意这一点。
