幕后黑手说
千利休幕后黑手说
此说法为中津文彦（昭和57年以《黄金流砂》获得江户川乱步赏,着有“闇之本能寺”）所提出。
世称为本能寺之变的信长暗杀事件，最大谜团是信长为什么要在天正10年（1582年）5月29日这一天到京都来，信长应该不是预定这天要上洛，出兵西国的军团整备还要几天才要开始，信长应该在安土城率领大军出发的，不是吗？改变原定计划的信长，提早到了京都让光秀有机可乘，造成连命都保不住的困境，这是信长的记录中，悔恨莫及的大失算。
这一年，信长最放心不下的武田家终于攻灭，这是从3月开始的事情，4月21日，结束战后处理的织田军凯旋返抵安土城，此时正是农忙时期，杂兵、步兵等人员必须片刻不休地立刻投入农事，在那之后也要休养生息，故西国远征的出兵计划从6月开始。秀吉远征西国的出发时间，已经是在4年半以前的天正5年10月的事情，因为领土实在太广大，从毛利军中间出发的秀吉传令兵，抵达已经是5月15日的事情，信长向光秀发出早日增援秀吉的命令，而信长本人的直属部队，应该在6月5日或6日左右出发比较合理。
光秀在5月17日到达近江阪本城，而后返回丹波的龟山城，大概整备了1万3千人的军队；另一方面，长男的信忠在5月21日率领2千人的部队进入京都妙觉寺，显然是为了信长要上洛的先前警备工作，至于为什么信长要在军队整备完成以前就提早上洛仍是谜团。
信长抵达京都的隔天，在居处的本能寺举办茶会，传说信长也很喜欢收集茶具，信长邀请了朝廷公卿和堺地的大商人们，在茶会中展示了安土城收集的38种茶道名器,茶会之后则是酒会，这里有个人值得注意，他是博多的大商人鸟居宗室，信长曾听说过天下有三大茶道名器，初花、新田及楢柴，信长已经拥有初花和新田，最后的楢柴在鸟居宗室手上，信长向鸟居交涉，请他割爱楢柴，顺带一提，鸟居宗室预定天正10年（1582年）6月2日离开京都，或许就为了这个理由信长才会提早上洛。
信长与鸟居宗室素不相识，信长可能会为了要向鸟居交涉取得楢柴，而在军队整备之前来到京都，千休利巧妙利用信长渴望获得茶器的心理，大胆地实施这个阴谋。为什么说是千利休？利休得到信长的信赖，因为是茶道师傅，可以常常见到信长，而且利休也有动机，也有可能是利休跟堺地全体商人的意见。在那之前，信长流放了重臣，不知几次出难题给他们负担,即使是要大施杀戮之前仍跟没事人一般的信长让商人们非常畏惧。
至于光秀和利休串通的证据，在光秀袭击信长的前两天，光秀在和歌会中说出“时は今、天が下しる五月哉”的句中，这个和歌会中，堺地的商人里村绍巴也以和歌师傅的身份出席，里村绍巴和千利休的关系非常密切，为了让对信长不安的光秀能确实执行暗杀的任务，避免他半途而废，里村负责在旁监视。也就是说千利休是幕后黑手，明智光秀负责执行，而里村绍村监视光秀。
一党实行说
蜂须贺一党实行说
此说法由广濑仁纪（记者、小说家，专攻历史和经济）提出。
天正10年6月2日天刚亮，坐落于南北向的西洞院通和油小路之间，东西向的六角通和四条坊门通的法华宗巨刹——本能寺，被谋叛的明智光秀袭击，几乎已将天下霸权掌握在手中的前右大臣——织田信长，在此结束其四十九年壮阔的人生。各种佐证都无法确认这是绝对的事实。传说其动机是接待德川家康宴会的准备缺失，被信长严厉地斥责，并取消接待的职务，此时光秀的领地也被收回，代之以还是毛利所有的出云和石见，被激怒的光秀决心谋反，但这些事情在“信长公记”中都没提到，而是在里本的“太阁记”中突然出现，这些有可能不是事实。
不是非谋反不可的光秀，也看不到积极掌握霸权等作为的他到底凭恃着什么？在雨中登上爱宕山山坡的明智光秀，已经下定决心谋反大概是确定的，但是在打倒信长这件事情中，谁是幕后黑手？必须极力避免世情的混乱和家中的动乱，同时还要拉拢安抚其他势力，这些都要动用庞大的资金，不论是谁都会感到怀疑。
前年的6月25日羽柴秀吉攻击中国地区的大军出发前，刚好是由明智秀满代表主君，带着收藏在京都野村美术馆的茶道名器“明智井户”前往探病，他应该是派到羽柴处的密使，他和完全知道内情的斋藤利三两人共同催促光秀谋反，此外堺地商人千宗易的养子千利休也写了一封意味不明的书信，提到当夜信长确实住宿在本能寺的消息。
光秀全军1万3千人在龟山城外半里五町的野条集结完成，在晚上九点左右开始进军是大家都同意的说法。1万3千人分成两列前进应该是无误的，6千5百人的行军队列以步兵须间隔90公分推论将迤逦6.5公里长，如果再考虑骑马队和镏重队，将连绵超过8公里长。爱宕山在梅雨延绵下的夜空更显黑暗，在此状况下行军的光秀军，从野条走1里3町在老人坡开始爬坡，再过半里17町到达中间点沓挂，在此休息片刻，在深夜零点开始行动。
而后走了1里17町到达桂川的西岸，在古书记载约深夜1点抵达，然而即使先锋抵达河岸，此时中军应该还没到达沓挂，而梅雨季节的桂川河宽超过300米，河水湍急，少数人马根本没办法渡河，等到后续部队到达，完成架桥作业，全军渡过桂川抵达东岸，已经超过早上三点，但此时洛中东南方，西洞院本能寺周边的晨曦已被火炎染红，怎么想也不可能是光秀的部队所为。没有攻击本能寺的明智光秀率军在早上8点的时候，攻击在勘解由小路町（鸟丸三条坊门）二条馆的织田信忠。
知道秀吉暗中谋取霸业的近卫前久，靠着德川家康逃亡到三河，同时秀吉心腹的蜂须贺小六正胜的同党，据说在尾张、美浓聚集了3万人之众，幕后主导的秀吉为了保护自己,将蜂须贺一党击破。结果相信“反信长同盟”的明智光秀，在历史上单独背负谋逆的恶名。
